Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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