Protein–RNA interactions for Protein: Q13617

CUL2, Cullin-2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL2Q13617 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL2Q13617 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms