Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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