Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EP300Q09472 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EP300Q09472 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EP300Q09472 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EP300Q09472 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EP300Q09472 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EP300Q09472 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EP300Q09472 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
EP300Q09472 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
EP300Q09472 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
EP300Q09472 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
EP300Q09472 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
EP300Q09472 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
EP300Q09472 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EP300Q09472 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EP300Q09472 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
EP300Q09472 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
EP300Q09472 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
EP300Q09472 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms