Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms