Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms