Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms