Protein–RNA interactions for Protein: Q01433

AMPD2, AMP deaminase 2, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD2Q01433 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AMPD2Q01433 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
AMPD2Q01433 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
AMPD2Q01433 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
AMPD2Q01433 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
AMPD2Q01433 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
AMPD2Q01433 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
AMPD2Q01433 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMPD2Q01433 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms