Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms