Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms