Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PLNP26678 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PLNP26678 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PLNP26678 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PLNP26678 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PLNP26678 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PLNP26678 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PLNP26678 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PLNP26678 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PLNP26678 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PLNP26678 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PLNP26678 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PLNP26678 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PLNP26678 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PLNP26678 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PLNP26678 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PLNP26678 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PLNP26678 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PLNP26678 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PLNP26678 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PLNP26678 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms