Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VARSP26640 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VARSP26640 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VARSP26640 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VARSP26640 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VARSP26640 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VARSP26640 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VARSP26640 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VARSP26640 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VARSP26640 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VARSP26640 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VARSP26640 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VARSP26640 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VARSP26640 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VARSP26640 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VARSP26640 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VARSP26640 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VARSP26640 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VARSP26640 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VARSP26640 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VARSP26640 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VARSP26640 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VARSP26640 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VARSP26640 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VARSP26640 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VARSP26640 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VARSP26640 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VARSP26640 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VARSP26640 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VARSP26640 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VARSP26640 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms