Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms