Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

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Length 164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD247P20963 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD247P20963 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD247P20963 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD247P20963 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD247P20963 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD247P20963 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD247P20963 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD247P20963 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD247P20963 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD247P20963 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD247P20963 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD247P20963 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD247P20963 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD247P20963 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD247P20963 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD247P20963 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD247P20963 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD247P20963 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD247P20963 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD247P20963 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD247P20963 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD247P20963 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD247P20963 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD247P20963 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD247P20963 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD247P20963 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD247P20963 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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