Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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