Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLR2CP19387 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLR2CP19387 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLR2CP19387 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLR2CP19387 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2CP19387 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2CP19387 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2CP19387 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2CP19387 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2CP19387 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2CP19387 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2CP19387 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2CP19387 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2CP19387 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2CP19387 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2CP19387 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2CP19387 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2CP19387 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2CP19387 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2CP19387 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2CP19387 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2CP19387 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2CP19387 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2CP19387 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.05■□□□□ -0
POLR2CP19387 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2CP19387 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2CP19387 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2CP19387 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2CP19387 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2CP19387 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2CP19387 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2CP19387 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2CP19387 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2CP19387 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2CP19387 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2CP19387 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2CP19387 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2CP19387 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2CP19387 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2CP19387 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2CP19387 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2CP19387 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2CP19387 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2CP19387 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.03■□□□□ -0
POLR2CP19387 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2CP19387 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2CP19387 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2CP19387 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms