Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA1P17302 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA1P17302 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA1P17302 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA1P17302 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA1P17302 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA1P17302 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA1P17302 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA1P17302 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA1P17302 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA1P17302 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA1P17302 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA1P17302 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA1P17302 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA1P17302 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA1P17302 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA1P17302 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA1P17302 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA1P17302 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA1P17302 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA1P17302 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms