Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms