Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNAP12004 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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