Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFLP07196 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFLP07196 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFLP07196 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFLP07196 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFLP07196 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFLP07196 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFLP07196 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFLP07196 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFLP07196 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFLP07196 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFLP07196 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFLP07196 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFLP07196 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFLP07196 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFLP07196 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFLP07196 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFLP07196 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFLP07196 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFLP07196 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFLP07196 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFLP07196 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFLP07196 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFLP07196 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFLP07196 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFLP07196 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFLP07196 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFLP07196 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFLP07196 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFLP07196 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFLP07196 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFLP07196 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFLP07196 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFLP07196 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFLP07196 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFLP07196 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFLP07196 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFLP07196 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFLP07196 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFLP07196 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFLP07196 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFLP07196 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFLP07196 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFLP07196 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFLP07196 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFLP07196 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFLP07196 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFLP07196 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFLP07196 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFLP07196 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFLP07196 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFLP07196 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFLP07196 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFLP07196 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFLP07196 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFLP07196 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFLP07196 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFLP07196 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFLP07196 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFLP07196 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFLP07196 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFLP07196 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEFLP07196 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEFLP07196 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEFLP07196 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEFLP07196 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEFLP07196 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEFLP07196 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEFLP07196 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEFLP07196 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEFLP07196 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEFLP07196 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEFLP07196 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEFLP07196 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEFLP07196 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEFLP07196 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEFLP07196 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEFLP07196 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEFLP07196 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEFLP07196 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEFLP07196 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NEFLP07196 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEFLP07196 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEFLP07196 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEFLP07196 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEFLP07196 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEFLP07196 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEFLP07196 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEFLP07196 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEFLP07196 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEFLP07196 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEFLP07196 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEFLP07196 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEFLP07196 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEFLP07196 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEFLP07196 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEFLP07196 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEFLP07196 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NEFLP07196 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEFLP07196 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms