Protein–RNA interactions for Protein: O15533

TAPBP, Tapasin, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAPBPO15533 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAPBPO15533 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 864.6 ms