Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBDO15205 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBDO15205 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
UBDO15205 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UBDO15205 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBDO15205 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBDO15205 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBDO15205 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBDO15205 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UBDO15205 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UBDO15205 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBDO15205 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBDO15205 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBDO15205 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UBDO15205 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UBDO15205 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBDO15205 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UBDO15205 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UBDO15205 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UBDO15205 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBDO15205 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
UBDO15205 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UBDO15205 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBDO15205 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UBDO15205 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBDO15205 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBDO15205 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBDO15205 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBDO15205 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBDO15205 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBDO15205 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBDO15205 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBDO15205 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBDO15205 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBDO15205 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBDO15205 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBDO15205 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBDO15205 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBDO15205 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBDO15205 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBDO15205 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBDO15205 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBDO15205 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBDO15205 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBDO15205 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBDO15205 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms