Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms