Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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