Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms