Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSPNQ9HAW4 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLSPNQ9HAW4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLSPNQ9HAW4 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSPNQ9HAW4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms