Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms