Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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RABGGTAQ92696 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
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RABGGTAQ92696 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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RABGGTAQ92696 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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RABGGTAQ92696 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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RABGGTAQ92696 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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RABGGTAQ92696 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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RABGGTAQ92696 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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