Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms