Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DUX4L9Q6RFH8 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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