Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms