Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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