Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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GTF2H2Q13888 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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GTF2H2Q13888 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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GTF2H2Q13888 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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GTF2H2Q13888 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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GTF2H2Q13888 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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