Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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CBX3Q13185 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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CBX3Q13185 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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CBX3Q13185 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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CBX3Q13185 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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CBX3Q13185 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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CBX3Q13185 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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CBX3Q13185 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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CBX3Q13185 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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CBX3Q13185 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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CBX3Q13185 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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CBX3Q13185 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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CBX3Q13185 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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CBX3Q13185 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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CBX3Q13185 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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CBX3Q13185 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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