Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms