Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HBBP68871 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HBBP68871 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms