Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms