Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms