Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CTSSP25774 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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CTSSP25774 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CTSSP25774 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTSSP25774 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTSSP25774 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTSSP25774 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTSSP25774 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTSSP25774 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTSSP25774 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CTSSP25774 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTSSP25774 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTSSP25774 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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