Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA6P23229 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms