Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2RAP15509 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms