Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAV1P15498 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAV1P15498 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAV1P15498 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAV1P15498 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAV1P15498 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAV1P15498 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAV1P15498 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAV1P15498 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAV1P15498 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAV1P15498 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAV1P15498 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAV1P15498 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAV1P15498 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAV1P15498 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAV1P15498 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAV1P15498 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAV1P15498 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAV1P15498 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAV1P15498 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAV1P15498 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAV1P15498 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAV1P15498 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAV1P15498 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAV1P15498 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VAV1P15498 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VAV1P15498 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VAV1P15498 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAV1P15498 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAV1P15498 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAV1P15498 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAV1P15498 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAV1P15498 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAV1P15498 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms