Protein–RNA interactions for Protein: O00574

CXCR6, C-X-C chemokine receptor type 6, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR6O00574 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms