Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX10Q9Y5X0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX10Q9Y5X0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX10Q9Y5X0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX10Q9Y5X0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX10Q9Y5X0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX10Q9Y5X0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX10Q9Y5X0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX10Q9Y5X0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX10Q9Y5X0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX10Q9Y5X0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX10Q9Y5X0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX10Q9Y5X0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX10Q9Y5X0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX10Q9Y5X0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX10Q9Y5X0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX10Q9Y5X0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX10Q9Y5X0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX10Q9Y5X0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX10Q9Y5X0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX10Q9Y5X0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX10Q9Y5X0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX10Q9Y5X0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX10Q9Y5X0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX10Q9Y5X0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX10Q9Y5X0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX10Q9Y5X0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX10Q9Y5X0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX10Q9Y5X0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX10Q9Y5X0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX10Q9Y5X0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX10Q9Y5X0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX10Q9Y5X0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX10Q9Y5X0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX10Q9Y5X0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SNX10Q9Y5X0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms