Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G9

PCDHGA4, Protocadherin gamma-A4, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA4Q9Y5G9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCDHGA4Q9Y5G9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHGA4Q9Y5G9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHGA4Q9Y5G9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHGA4Q9Y5G9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHGA4Q9Y5G9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHGA4Q9Y5G9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHGA4Q9Y5G9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHGA4Q9Y5G9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHGA4Q9Y5G9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHGA4Q9Y5G9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHGA4Q9Y5G9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHGA4Q9Y5G9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHGA4Q9Y5G9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHGA4Q9Y5G9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHGA4Q9Y5G9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHGA4Q9Y5G9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHGA4Q9Y5G9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHGA4Q9Y5G9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHGA4Q9Y5G9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHGA4Q9Y5G9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms