Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHOC2Q9UQ13 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
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