Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
AGTPBP1Q9UPW5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AGTPBP1Q9UPW5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
AGTPBP1Q9UPW5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AGTPBP1Q9UPW5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
AGTPBP1Q9UPW5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
AGTPBP1Q9UPW5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
AGTPBP1Q9UPW5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AGTPBP1Q9UPW5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
AGTPBP1Q9UPW5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
AGTPBP1Q9UPW5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
AGTPBP1Q9UPW5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
AGTPBP1Q9UPW5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
AGTPBP1Q9UPW5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
AGTPBP1Q9UPW5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
AGTPBP1Q9UPW5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AGTPBP1Q9UPW5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AGTPBP1Q9UPW5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
AGTPBP1Q9UPW5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
AGTPBP1Q9UPW5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
AGTPBP1Q9UPW5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
AGTPBP1Q9UPW5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AGTPBP1Q9UPW5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AGTPBP1Q9UPW5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AGTPBP1Q9UPW5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
AGTPBP1Q9UPW5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AGTPBP1Q9UPW5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AGTPBP1Q9UPW5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
AGTPBP1Q9UPW5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
AGTPBP1Q9UPW5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms