Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL4

ING4, Inhibitor of growth protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ING4Q9UNL4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ING4Q9UNL4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ING4Q9UNL4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ING4Q9UNL4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ING4Q9UNL4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ING4Q9UNL4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ING4Q9UNL4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ING4Q9UNL4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ING4Q9UNL4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ING4Q9UNL4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ING4Q9UNL4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ING4Q9UNL4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms