Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
L1RE1Q9UN81 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
L1RE1Q9UN81 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms