Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM19

HPCAL4, Hippocalcin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL4Q9UM19 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HPCAL4Q9UM19 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPCAL4Q9UM19 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms